当我们修改一个apk并重新签名后，签名不匹配可能是由于以下几个原因导致的：
1. 签名信息被篡改：如果对apk进行了篡改，比如修改了文件内容或添加了恶意代码等，那么修改后的签名就会和原始签名不一致。
2. 签名算法不匹配：Android应用签名使用的是RSA算法，如果在重新签名时选择了错误的签名算法，那么签名结果就会和原始签名不一致。
3. 工具使用不正确：重新签名apk时，需要使用相关的工具来进行操作，比如`jarsigner`命令行工具。如果在使用工具的过程中参数配置错误或者操作步骤不正确，也会导致签名不匹配的问题。
针对以上的问题，我们可以采取以下措施解决：
1. 检查apk是否被篡改：可以使用apk校验工具，比如`jarsigner`命令行工具或Android Studio的`Verify`功能，来验证apk的签名是否和原始签名一致。如果不一致，很可能是apk被篡改了。
2. 确认签名算法：在重新签名时，需要使用正确的签名算法。通常情况下，我们可以使用Android SDK中的`jarsigner`命令行工具来进行签名操作，命令参数大致如下：
```
jarsigner -verbose -sigalg SHA1withRSA -digestalg SHA1 -keystore
```
其中，`
3. 重新签名：如果确定签名算法和工具操作无误，那么可以尝试重新签名。在重新签名前，可以先将原始apk文件备份，防止操作错误导致数据丢失。重新签名可以按照以下步骤进行：
- a. 使用`jarsigner`命令将apk进行签名：
```
jarsigner -verbose -sigalg SHA1withRSA -digestalg SHA1 -keystore
```
- b. 使用`jarsigner`命令检查签名：
```
jarsigner -verify -verbose
```
如果签名结果显示`jar verified.`，则表示重新签名成功。
4. 使用合法的签名机构签名：如果以上方法无效，可以考虑使用合法的签名机构的证书进行签名。这种方式需要购买合法的签名机构的证书，可以保证签名的合法性和安全性。
总结起来，当apk修改后签名不对时，我们可以通过确认签名算法和工具操作无误、重新签名，或者使用合法的签名机构的证书来解决问题。在操作过程中，务必保持谨慎，防止数据丢失或者更多的问题产生。
